Podstawową działalnością COI jest wykonywanie usług na rzecz MSW w zakresie budowy, rozwoju i eksploatacji systemów teleinformatycznych. Do najważniejszych zadań w tym zakresie należy prowadzenie Centralnej Ewidencji Pojazdów (CEP) oraz Centralnej Ewidencji Kierowców (CEK), w tym systemu informatycznego Centralnej Ewidencji Pojazdów i Kierowców (SI CEPiK).
W ramach swojej działalności COI świadczy również usługi informatyczne dla innych jednostek i jest otwarty na współpracę przy nowych projektach.